Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms