Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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NR1H3Q13133 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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