Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP4Q13107 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP4Q13107 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
USP4Q13107 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP4Q13107 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP4Q13107 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP4Q13107 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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