Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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BPTFQ12830 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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BPTFQ12830 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
BPTFQ12830 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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