Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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