Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ERVV-1B6SEH8 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ERVV-1B6SEH8 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ERVV-1B6SEH8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ERVV-1B6SEH8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ERVV-1B6SEH8 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ERVV-1B6SEH8 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms