Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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