Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CSPP1Q1MSJ5 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms