Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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ECM1Q16610 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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