Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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