Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF6Q13247 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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