Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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