Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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