Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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