Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms