Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms