Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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HOXA4Q00056 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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HOXA4Q00056 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXA4Q00056 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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