Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPRBP23467 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRBP23467 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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