Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMOD3Q9NYL9 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms