Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDGFDQ9GZP0 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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