Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED9Q6R2W3 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms