Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BBS9Q3SYG4 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms