Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ECM1Q16610 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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