Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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