Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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NKX1-1Q15270 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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NKX1-1Q15270 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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NKX1-1Q15270 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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