Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms