Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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