Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CNGB1Q14028 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms