Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA7Q13683 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms