Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms