Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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