Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
AP3B2Q13367 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms