Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms