Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RIGQ13278 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RIGQ13278 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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