Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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