Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FAM3AP98173 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms