Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GOPCQ9HD26 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GOPCQ9HD26 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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