Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 LMCD1-AS1-203ENST00000441861 2683 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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