Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMG1Q96Q15 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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