Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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