Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CFAP47Q6ZTR5 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CFAP47Q6ZTR5 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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