Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms