Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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E2F4Q16254 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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E2F4Q16254 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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