Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCDC85BQ15834 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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