Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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