Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms