Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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