Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
XRCC4Q13426 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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