Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SKP2Q13309 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SKP2Q13309 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SKP2Q13309 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SKP2Q13309 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKP2Q13309 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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