Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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